Sir koji se stavlja na pizzu bi trebao biti hladan jer se korištenjem toplog sira on može prepeći pa čak i zagoriti. Sir uvijek treba naribati bilo na sitnije ili krupnije komade, a tvrde sireve je moguće i narezati rezačem na tanke listiće. Sa sirom ne valja pretjerivati pa se na pizzu promjera 30 cm preporuča staviti oko 150 g sira.
Mozzarella
Mozzarella se smatra klasičnim talijanskim izborom za pizzu. Postoji nekoliko vrsta mozzarelle i sve se vrste mogu koristiti za pripremu pizze, no zbog specifičnog bogatog okusa najhvaljenija je mozzarella od bivoljeg mlijeka. Može se dogoditi da svježa mozzarella na pizzi pusti previše vode čime se dobije gnjecavo tijesto. Tom problemu se može doskočiti na način da se mozzarella zamota u kuhinjsku krpu i objesi kako bi se ocijedila, no ovaj postupak je zahtjevan pa se višak vode može ukloniti i rezanjem mozzarelle na tanke kriške i brisanjem kuhinjskim papirom.
Feta sir
Iako feta sir nije uobičajeno stavljati na pizzu, njegov slani, pomalo zemljani okus, dobro podnosi pečenje i ne dolazi do narušavanja njegove strukture. Najbolje ga je kombinirati s drugim sirevima.
Sirevi s plemenitim plijesnima
Razmrvljeni sirevi s plemenitim plijesnima poput gorgonzole ili roqueforta na pizzi se odlično slažu sa svježim povrćem poput rukole i cherry rajčica. Ovakvi sirevi daju posebnu aromu pizzi, međutim, zbog jakog okusa ne treba pretjerivati. Osim u kombinaciji s drugim sirevima, sirevi s plemenitim plijesnima mogu se dodati i u pripremi bešamel umaka kod izrade "bijelih" pizza bez umaka od rajčice.
Parmezan
Zreli tvrdi sirevi poput parmezana ili sira grana padano pizzi daju profinjenu notu, no zbog delikatnosti njihovog okusa i suhoće, takvi se sirevi ne bi smjeli peći, već se ribaju ili režu na tanke listiće i dodaju nakon pečenja.
Gouda
U našim krajevima na pizzama prevladavaju polutvrdi masni sirevi od kravljeg mlijeka poput goude ili podravca koji imaju kremastu strukturu. Odlični su za kombiniranje s drugim sirevima poput mozzarelle, feta sira, sireva s plemenitim plijesnima pa čak i s dimljenim sirevima ili kozjim i ovčjim.
